Jejím úkolem je zabezpečovat naplňování zákona č. 541/2020 Sb., o odpadech, ve znění pozdějších předpisů, a zákona č. 201/2012 Sb., o ochraně ovzduší, ve znění pozdějších předpisů.
Řeší žádosti o povolení nakládání s nebezpečnými odpady, o vyjádření k podnikání v oblasti nakládání s odpady pro potřeby živnostenského úřadu, ke zřízení zařízení k odstraňování odpadů, o vyjádření k územnímu a stavebnímu řízení z hlediska nakládání s odpady nebo k připravovaným změnám výrobního procesu nebo výroby, které mají vliv na nakládání s odpady.
Dále vede a zpracovává evidenci odpadů a způsobů nakládání s nimi a evidenci zařízení k nakládání s odpady (skládky, kompostárny, spalovny apod.).
Jejím úkolem je zpracovávání evidence jí vydaných souhlasů a dalších rozhodnutí podle zákona o odpadech a na požádání podává informace veřejnosti a žadatelům o sídle zařízení vhodných k odstranění nebo využití jimi vyprodukovaného odpadu. Zpracované údaje poskytuje ministerstvu.
Projednává přestupky na úseku odpadového hospodářství a ochrany ovzduší.
Zajišťuje vydávání jednotných environmentálních stanovisek odboru.